Au delà des missions qu'elle s'est fixée en faveur du développement économique de son territoire, la CCI Bayonne Pays Basque a une spécialité reconnue. Elle constitue une porte ouverte sur la Péninsule Ibérique et l'Amérique Latine avec une offre performante d'actions en direction de ces marchés.

Par ailleurs, elle a innové en matière de formation en créant l'école d'ingénieurs ESTIA, devenue une référence dans la communauté scientifique.